– Отделение радиологии № 1 – амбулаторная радиология;
– Отделение радиологии № 2 – общая радиология; 
– Отделение радиологии № 3 – радиогинекология; 
– Отделение радиологии № 4 – медицинская физика;
– Отделение радиологии № 5 – лучевая топометрия и лучевая диагностика;
– Республиканский центр высокотехнологичной специализированной медицинской помощи пациентам с локализованными формами рака предстательной железы (брахитерапии);
– Служба радиационной безопасности.
Оборудование для наружного облучения установлено в 6 специализированных каньонах:
– высокоэнергетический линейный ускоритель электронов «Elekta Synergy» (Elekta, Англия) с тремя ступенями тормозного и шестью ступенями электронного излучения, муль-тилиф-коллиматором, системой портальной визуализацией IVIEWGT и системой 3-х мерной рентгеновской визуализации XVI, что позволяет реализовывать самые современные методики 3D-конформного облучения, модулированной по интенсивности (IMRT) и визуально-управляемой (IGRT) лучевой терапии;
– два ускорителя SL-75 (Philips, Англия);
– два кобальтовых аппарата с автоматическим управлением «РОКУС-АМ» («Равенство», Россия);
– гамма-терапевтический аппарат Theratron Equinox 80 (Best Teratronic, Канада).
    Блок контактной лучевой терапии оснащен тремя аппаратами для брахитерапии: «АГАТ-В3», «Gammamed -12 i » и «MultiSource HDR», аппаратами для близкофокусной и глубокой рентгенотерапии Xstrahl-200, Xstrahl-300 (Англия).
   Для предлучевой подготовки (лучевой топометрии и клинической дозиметрии) име-ются специализированный КТ-стимулятор с широкой апертурой гентри и системой лазерных центраторов Light Speed RT 16 (США), рентгеновский аппарат С-дуга, анализаторы дозного поля МР-3 PTW и WELLHOFER WP 600, водные фонтомы (WP-600, Blue Fantom 2, MatriXи др., 8 компьютерных систем планирования (HELIX, ROCS, Gammaplan, XIO 3D, PSID-4.0, HDR-plan, Rx-plan , In-plan), клинические дозиметры (PTW-UNIDOS Freiburg, Dose1, KEINHLEY), станция оконтуривания Focal, информационно-управляющая система Mosaiq и другие аксессуары (плавильная комната для изготовления индивидуальных защитных блоков из низкотемпературного свинца, средства иммобилизации – breastbord, термомаски, вакуумные матрацы и пр.). В повседневной практике используется система лазерного сопровождения лучевой терапии на родаминовых приборах АЛТ-02.
  Центр брахитерапии оснащен специализированной операционной, которая располагает столом для брахитерапии со специальными подставками для ног, аппаратом УЗИ BRUEL &KLAER (Дания) с ректальным датчиком, персональным компьютером с системой планирования брахитерапии, зарядной станцией для игл, манипулятором с шаблоном для имплантации.
Персонал. Всего более 120 сотрудников. Среди них – 1 доктор медицинских наук, профессор, 6 кандидатов медицинских наук, 20 врачей высшей и 12 – первой квалификаци-онной категории. Врачебный персонал прошел профессиональную подготовку в ведущих институтах и специализированных центрах России (медицинские академии последипломного образования Санкт-Петербурга и Москвы, Российского онкологического научного центра РАМН, Центрального научно-исследовательского рентгенорадиологического института, Московского научно-исследовательского онкологического института им. Герцена, Российского научного центра рентгенорадиологии Минздрава РФ и медицинского радиологического научного центра РАМН, г. Обнинск) и Европы (Великобритании, Германии, Франции, Австрии, Бельгии, Голландии, Люксембурга и др.). О высоком уровне теоретической и клинической подготовки сотрудников свидетельствует участие в десятке международных многоцентровых рандомизированных исследованиях по лечению больных раком головы и шеи, легкого, молочной железы, колоректальному, гинекологическому раку. Внедрена брахитерапия рака предстательной железы зернами Йода-125. Отработана методика стандартного лечения детей острым лимфобластным лейкозом по программе ALL-BFM-90 и последующим моди-фикациям. Все дети получают лучевую терапию только по этому протоколу. Внедрена стандартная программа лечения больных нефробластомой – SIOP . В отделениях накоплен со-лидный опыт химиолучевого лечения с современными фторпиримидинами (томудекс, кселода), применяются оригинальные методики химолучевой терапии злокачественных глиом головного мозга с тенипозидом, аранозой; лазерной профилактики и лазерной терапии лучевых реакций и повреждений, неконвенциального фракционирования дозы облучения, применения электрон-акцепторных радиосенсибилизаторов, эпоитинов, радиопротекторов и др.
    Ежегодно в радиологических отделениях лечение получают около 5 тыс. пациентов.
    За последние 5 лет в научной печати радиологами, совместно с коллегами, опублико-вано свыше 200 статей и тезисов (в том числе – 5 монографий), получено 12 патентов, автор-ских свидетельств на изобретения и рацпредложения.
  Возглавляет радиологическую службу заместитель главного врача Фагим Фанисович Муфазалов – доктор медицинских наук, профессор, главный внештатный радиолог МЗ РБ, Президент Ассоциации радиологов (лучевых диагностов и лучевых терапевтов) Башкортостана им. профессора Б. Б. Кудашева